Η πρωτεομική επικεντρώνεται στη δυναμική περιγραφή της ρύθμισης των γονιδίων, τον ποσοτικό προσδιορισμό των επιπέδων πρωτεϊνών της γονιδιακής έκφρασης, τον προσδιορισμό των επιπτώσεων ασθενειών και φαρμάκων στις διαδικασίες ζωής και την εξήγηση του μηχανισμού ρύθμισης της γονιδιακής έκφρασης. Ως επιστήμη, η έρευνα πρωτεομικής δεν είναι από το μηδέν Αρχικά, είναι μια επέκταση του προφίλ πρωτεΐνης (πεπτίδιο) και της τεχνολογίας χαρτογράφησης γονιδίων που έχει χρησιμοποιηθεί για περισσότερα από 20 χρόνια. Η χαρτογράφηση πεπτιδίων βασίζεται σε δισδιάστατη ηλεκτροφόρηση πηκτής (2-DE) και περαιτέρω ανάλυση εικόνας. και γονίδιο Το προφίλ του προϊόντος εξαρτάται από μια ποικιλία αναλύσεων μετά το διαχωρισμό, όπως φασματομετρία μάζας, ανάλυση σύνθεσης αμινοξέων κ.λπ.
Λόγω της ύπαρξης μεταβλητής επεξεργασίας και επεξεργασίας RNA, πολλά γονίδια μπορούν να εκφράσουν μια ποικιλία διαφορετικών πρωτεϊνών. Ως εκ τούτου, η πολυπλοκότητα του πρωτέματος είναι πολύ υψηλότερη από την πολυπλοκότητα του γονιδιώματος.
Εάν έχει αποκρυπτογραφηθεί ολόκληρη η αλληλουχία γονιδιώματος ενός είδους, αυτό δεν σημαίνει ότι έχει επίσης αποκρυπτογραφηθεί το πρωτέα αυτού του είδους. Η ειδική ανάλυση του πρωτεϊνικού προϊόντος ενός γονιδίου θα πρέπει να προσδιορίζεται με την πλήρη τροποποίηση και ρύθμιση του επιπέδου γονιδιώματος, του επιπέδου μεταγραφής και του επιπέδου μετάφρασης.