Βακτηριακή ανακάλυψη
Τα βακτηρίδια ανακαλύφθηκαν για πρώτη φορά από τον Ολλανδό Αντόνιο Βαν Λέιβεμχοκ (1632-1723) σε ταρταριού ενός ηλικιωμένου που δεν είχε βουρτσίσει τα δόντια του, αλλά εκείνη τη στιγμή οι άνθρωποι πίστευαν ότι τα βακτήρια παράγονται φυσικά. Μέχρι αργότερα, ο Παστέρ χρησιμοποίησε πειράματα gooseneck για να δείξει ότι τα βακτηρίδια παράγονται από τα βακτήρια στον αέρα αντί να δημιουργούν αυτογενείς και εφευρέθηκε η «μέθοδος παστερίωσης», η οποία αργότερα ονομάστηκε «ο πατέρας των μικροοργανισμών».
Ο όρος βακτήρια προτάθηκε αρχικά από τον Γερμανό επιστήμονα Christian Gottfried Ehrenberg (1795-1876) το 1828 για να αναφέρεται σε ένα συγκεκριμένο βακτήριο. Η λέξη προέρχεται από το ελληνικό βακτηριακό, που σημαίνει "μικρό ραβδί".
Το 1866, ο γερμανός ζωολόγος Ernst Haeckel (1834-1919) πρότεινε τη χρήση «φυσικών οργανισμών», συμπεριλαμβανομένων όλων των μονοκύτταρων οργανισμών (βακτήρια, άλγη, μύκητες και πρωτόζωα).
Το 1878, ο γάλλος χειρούργος Charles Emmanuel Sedillot (1804-1883) πρότεινε "μικροοργανισμούς" για να περιγράψει τα βακτηριακά κύτταρα ή πιο συχνά χρησιμοποιείται για να αναφέρεται σε μικροσκοπικούς οργανισμούς.
Επειδή τα βακτήρια είναι μονοκύτταροι μικροοργανισμοί που είναι αόρατοι με γυμνό μάτι, πρέπει να παρατηρούνται με μικροσκόπιο. Το 1683, ο Antonie van Leeuwenhoek (1632-1723) παρατηρούσε για πρώτη φορά βακτηρίδια χρησιμοποιώντας ένα μικροσκόπιο μονής φακής που σχεδίασε ο ίδιος, περίπου μια μεγέθυνση 200 φορές. Ο Louis Pasteur (1822-1895) και ο Robert Koch (1843-1910) επεσήμαναν ότι τα βακτήρια μπορεί να προκαλέσουν ασθένεια.